Pētījuma aktivitāte Nr.5.
Iegūto
savienojumu spektrālo parametru noteikšana saistībā ar biomolekulām
Pētījuma vadītājs
Inta
Kalniņa,
Dr.med., Daugavpils Universitāte
Pētījuma aktivitātes mērķi
Izpētīt
sintezēto fluorescento savienojumu spektrālos parametrus saistībā ar
biomolekulām
Pētījuma aktivitātes uzdevumu un veicamo darbu izklāsts
Pētījumu aktivitātes
uzdevumi:
1. Veikt
zinātniskās literatūras un patentu analīzi.
2. Izvērtēt
saistīšanas iespējas un parametrus.
3. Ar
fluorescentās analīzes palīdzību iegūt saistītu fluoroforu spektrālo
raksturojumu.
4. Sagatavot
patentu pieteikumu fluorescento zonžu izmantošanai biomolekulu pētījumos.
Aktivitātes īstenošanas sākumā
un arī tālākos posmos tiks veikta jaunāko zinātnisko darbu un patentu analīze.
Dotajā aktivitātē ir plānots
pētīt aktivitātē Nr.2. jauniegūto savienojumu fluorescences īpatnības, tiem
saistoties ar olbaltumvielām, lipīdiem un nukleīnskābēm. Īpašu interesi izraisa
saistīšana ar albumīnu, jo tieši proteīnu dinamika nosaka daudzas šūnu
funkcionālās īpašības. Albumīns ir viens no visbagātīgāk pārstāvētajām
olbaltumvielām cilvēku asins plazmā. Tādēļ ir svarīgi klīniskajos pētījumos
sekot un novērtēt albumīna transporta funkciju. Daudzi jautājumi par šūnu
membrānu struktūru, fizikālajām īpašībām saistībā ar albumīna struktūru (sevišķi
molekulas triptofanila apgabala), funkcionālo lomu ligandu un to oksidācijas
produktu transportu pie dažādām patoloģijām paliek neskaidrs. Albumīna izmaiņu
kvalitatīva analīze saistībā ar imunologisko parametru (perifēro asins
mononukleāro šūnu subpopulāciju sadalījumu) palīdzētu noskaidrot visu iepriekš
minēto parametru izmaiņu savstarpējās likumsakarības un īpatnības pie dažādām
patoloģijām (onkoloģiskā profila slimnieki) un ārējo faktoru ietekmē uz
organismu (jonizējošais starojums). Līdz šim nav sistemātisku pētījumu par
albumīna triptofanila apgabala strukturālajām īpatnībām, kurām ir liela nozīme
saistību centru izvietojumā un to īpašībās (t.sk. hidrofobitātē), kas nosaka
albumīna transporta funkcijas efektivitāti. Darbā paredzēts noteikt albumīna
saistību vietu specifiskumu, hidrofobitāti, afinitāti un saistību centru skaitu.
Šajā aktivitātē tiks iesaistīta Dr. phys. G. Gorbenko no Ukrainas, kurai ir
liela pieredze starpmolekulāro mijiedarbību pētīšanā ar fluorescentām zondēm.
Analoģiskus pētījumus ir
plānots veikt ar augu olbaltumvielām (un šos datus izmantot augu šūnās notiekošo
procesu pētīšanai aktivitātē Nr.6.), kā arī ar nukleīnskābēm un lipīdiem
(holesterīnu, fosfolipīdiem u.c.). Šajā aktivitātē ir plānots izmantot
bioķīmisku procesu matemātiskās modelēšanas metodes (aktivitātes Nr.8. ietvaros), lai noskaidrot gan lipīdu, gan olbaltumvielu saistīšanas mehānismus
un to ietekmi uz šūnu membrānu dinamiku un funkcijām. Balstoties uz iegūtajiem
rezultātiem, plānojam izstrādāt fluorescentas metodes klīnikai, lai sekotu,
novērtētu un nepieciešamības gadījumā koriģētu asins transporta funkciju.
|